Первая в Москве и вторая в России детская больница открылась 6 декабря 1842 года. Об этом в течение многих лет настойчиво ходатайствовали московские врачи, которых удручала высокая детская смертность и то, что дети лечились в больницах для взрослых.
Сейчас Детская городская клиническая больница № 13 им. Н. Ф. Филатова оказывает медицинскую помощь детскому населению по программам ОМС и ДМС, а также платные услуги по тарифам, согласованным с Департаментом здравоохранения г. Москвы.
C января 2008 года в детской городской клинической больнице № 13 имени Н.Ф. Филатова работает Отделение кардиохирургии для детей. Оно принимает до 25 пациентов и в нем может быть выполнено до 250-ти операций в год детям с врожденными пороками сердца. Ежегодно в Москве более тысячи детей рождаются с врожденным пороком сердца (ДМЖП, ДМПП, Тетрада Фалло, открытый артериальный проток и прочие), из них около трети нуждается в неотложном хирургическом вмешательстве в течение первого года жизни.
